Referansegruppene skal bidra til bred regional og administrativ forankring av Forsvarssamarbeidet Troms og Hålogaland. Gruppene tilfører prosjektet kunnskap, perspektiver og råd fra kommunene og de interkommunale politiske rådene, og bidrar til god informasjonsflyt og samordning på tvers av regionene. Samtidig fungerer de som viktige sparringspartnere for prosjektledelsen i utvikling og oppfølging av prosjektets arbeid.